万方查重中的自我抄袭检测的原理主要是通过文本比对技术，将用户上传的文档与万方数据库中的文献进行比对分析，检测文档中是否存在与已有文献相似的内容。具体而言，系统会对文档进行分词、建立索引、计算相似度等操作，最终给出相似度报告，帮助用户判断是否存在自我抄袭行为。

自我抄袭检测方法包括直接比对法、间接比对法和混合比对法。直接比对法是将用户上传文档与已有文献逐字逐句进行比对；间接比对法是将文档转换为特征向量后进行比对；混合比对法则结合了直接比对和间接比对的优点。通过这些方法，万方查重可以有效检测出文档中的自我抄袭行为，保障学术诚信。